Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc47Q505F5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrrc47Q505F5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc47Q505F5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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