Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms