Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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