Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Krtap1-4Q3V2D6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms