Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms