Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms