Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28047Q3US59 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms