Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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