Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mccc2Q3ULD5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms