Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ell2Q3UKU1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ell2Q3UKU1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ell2Q3UKU1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell2Q3UKU1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms