Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmod2Q3UHZ5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms