Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms