Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q3U6N9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms