Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U595 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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