Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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