Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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