Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gse1Q3U3C9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms