Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf40Q3U319 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf40Q3U319 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf40Q3U319 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf40Q3U319 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf40Q3U319 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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