Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms