Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Palb2Q3U0P1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms