Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ctdnep1Q3TP92 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ctdnep1Q3TP92 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ctdnep1Q3TP92 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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