Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc127Q3TC33 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms