Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptcd3Q14C51 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms