Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf3ip1Q149C2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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