Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VgfQ0VGU4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms