Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms