Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps8Q0P5W1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps8Q0P5W1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms