Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrioQ0KL02 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms