Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q08AU9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q08AU9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q08AU9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q08AU9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q08AU9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms