Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms