Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
NrepQ07475 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NrepQ07475 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms