Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms