Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Siah2Q06986 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms