Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms