Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fmn1Q05860 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms