Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms