Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms