Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Muc1Q02496 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Muc1Q02496 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms