Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ank1Q02357 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ank1Q02357 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms