Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms