Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrcdQ00LT2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms