Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfcP97953 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfcP97953 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfcP97953 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms