Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp7P97864 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp7P97864 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms