Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
AlkP97793 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AlkP97793 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AlkP97793 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AlkP97793 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AlkP97793 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms