Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bop1P97452 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bop1P97452 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Bop1P97452 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Bop1P97452 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bop1P97452 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Bop1P97452 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms