Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms