Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Usp9xP70398 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Usp9xP70398 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp9xP70398 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms