Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad1P70340 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms