Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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