Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms